ESMFold2结合物二级结构引导实验公开
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ESMFold2结合物二级结构引导实验公开
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AI 综述
研究者 memebheem 在不重新训练 ESMFold2 的前提下,加入螺旋几何惩罚项,引导其生成的结合物设计改变二级结构组成。研究者发现 ESMFold2 生成的结合物 α-螺旋含量高于天然蛋白,于是在五个靶点上用该惩罚项提升了 β-折叠与 loop 含量,但平均置信度分数下降。 团队公开了代码、预测结构和优化轨迹,供希望控制结合物组成的研究者使用。这些实验只说明引导如何改变计算预测;所得蛋白能否折叠并结合目标仍待验证。
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最新进展10月30日 23:55
ESMFold2 结合物设计引导:调整二级结构组成的实验报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月30日
- Hacker NewsESMFold2 结合物设计引导:调整二级结构组成的实验
研究者发现 ESMFold2 生成的结合物设计 α-螺旋含量高于天然蛋白,于是在不重新训练模型的前提下加入螺旋几何惩罚项,在五个靶点上提升了 β-折叠与 loop 含量,但平均置信度分数下降。团队公开了代码、预测结构和优化轨迹,供希望控制结合物组成的研究者使用。这些实验只说明引导如何改变计算预测,所得蛋白能否折叠并结合目标仍待验证。
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