ESMFold2 结合物设计引导：调整二级结构组成的实验

研究者发现 ESMFold2 生成的结合物设计 α-螺旋含量高于天然蛋白，于是在不重新训练模型的前提下加入螺旋几何惩罚项，在五个靶点上提升了 β-折叠与 loop 含量，但平均置信度分数下降。团队公开了代码、预测结构和优化轨迹，供希望控制结合物组成的研究者使用。这些实验只说明引导如何改变计算预测，所得蛋白能否折叠并结合目标仍待验证。